学术报告(9.23):毛家顺: 用最优传输指标推断单细胞数据的基因轨迹
报告时间:2025年9月23日(周二)下午15:00-16:00
报告地点:苏州大学本部维格堂319
报告人: 毛家顺,西南医科大学副教授
摘要:
单细胞RNA测序已被广泛用于研究细胞分裂状态转换和生物过程的基因动态。目前推断过程中基因序列动态的策略通常依赖于通过细胞轨迹推断构建细胞伪时序。然而,同一组细胞状态下同时存在多个基因表达过程和技术噪音会掩盖所研究过程的真实进展。一个渐进的动态生物过程通常受到精细调控的基因级联的影响,其中基因按序被激活和失活,从而决定细胞状态的转录组变化。基因轨迹(GeneTrajectory)方法,通过计算基因分布的最佳传输距离来识别基因轨迹,而非细胞轨迹,从而准确提取基因程序并定义基因伪时序。
报告人简介:
毛家顺,西南医科大学-医学信息与工程学院-特聘副教授。四川省高等教育学会计算机基础教育研究专业委员会、四川省高等院校计算机基础教育研究会第八届理事会理事,四川省卫生信息学会数字医养专业委员会委员。博士毕业于韩国延世大学融合生物技术学院,研究方向为计算系统生物学,AIDD,计算材料学,化学信息学,擅长AI for science,在生物医药和高分子复合材料设计的人工智能模型开发方面拥有多年基础研究经验。目前已发表文章17篇,其中一作或通讯文章9篇,包括三篇中科院一区top,其中一篇IF大于10,四篇中科院二区,两篇三区。分别发表在npj Comput. Mater, jctc, jpa, jcim,csbj, cheminformatics, iscience国际著名期刊。
邀请人:唐煜